4. Communication microbienne dans l'environnement naturel / "Quorum sensing" & "Quorum quenching"

Les océans couvrent plus de 70% de la surface de la Terre, sont impliqués dans la régulation du climat, de l'atmosphère, dans la production de ressources vivantes et non vivantes. Avec près de 5x105 cellules par ml, les procaryotes jouent un rôle central dans de nombreux cycles biogéochimiques. Au cours de ces 20 dernières années, les écologistes microbiens ont beaucoup travaillé sur la diversité des microorganismes dans l'environnement marin, ainsi que sur les facteurs de l'environnement contrôlant ces populations. Mais peu d'informations ont été acquises sur le rôle des interactions biotiques dans ces communautés, et en particulier sur les mécanismes de communication de cellule à cellule ("quorum sensing"), qui passent par la diffusion d'"hormones bactériennes" (autoinducteurs, AI). Ce constat est d'autant plus surprenant que ces mécanismes de communication cellulaire sont retrouvés chez de très nombreuses bactéries, et ont été particulièrement bien étudiés chez des modèles d'intérêt médical ou agronomique. L'étude de ces mécanismes en milieu marin ouvre de multiples perspectives tant du point de vue fondamental qu'appliqué (i.e., maitrise de la croissance des microorganismes par quorum-quenching, biofilms) Notre projet actuel (Emergence UPMC, 2012-2015) a pour ambition de mesurer la diversité et l'abondance des bactéries capables de communiquer par quorum sensing dans l'environnement naturel marin, ainsi que la diversité marine chimique de ces molécules de communication.